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地球生物基因組計(jì)劃啟動(dòng) 斥資47億美元測序150萬物種

時(shí)間:2018-11-05 10:09:03 來源: 新浪科技綜合


鴨嘴獸是為數(shù)不多的基因組已經(jīng)被測序的復(fù)雜生物之一。圖片來源:Dave Watts

鴨嘴獸是為數(shù)不多的基因組已經(jīng)被測序的復(fù)雜生物之一。圖片來源:Dave Watts

來源:中國科學(xué)報(bào)

11月1日,一項(xiàng)對全球所有復(fù)雜生物體基因組進(jìn)行測序的雄心勃勃的計(jì)劃在英國倫敦正式啟動(dòng)。

“基因變異是所有遺傳學(xué)知識的源泉。”項(xiàng)目成員之一、澳大利亞墨爾本拉籌伯大學(xué)進(jìn)化遺傳學(xué)家Jenny Graves說,“你擁有的基因變異越多就越好——那么為什么不對所有的事物展開測序呢?”

這項(xiàng)地球生物基因組計(jì)劃的目標(biāo)便是在未來10年內(nèi)對全世界約150萬種已知的動(dòng)物、植物、原生動(dòng)物和真菌物種(統(tǒng)稱為真核生物)的基因組進(jìn)行測序。這項(xiàng)倡議估計(jì)耗資47億美元,到目前為止只籌劃到其中的一小部分資金。

作為這項(xiàng)計(jì)劃的一部分,來自茵格斯頓市惠康桑格研究所的科學(xué)家宣布,他們計(jì)劃在未來8年的時(shí)間里花費(fèi)5000萬歐元(6500萬美元)對英國的真核生物基因組進(jìn)行測序,其數(shù)量約為66000種。

對惠康桑格研究所的支持——將來自該所的總體預(yù)算——是迄今為止對這項(xiàng)努力最大的承諾之一。

據(jù)美國加利福尼亞大學(xué)戴維斯分校進(jìn)化生物學(xué)家、地球生物基因組計(jì)劃工作組主席Harris Lewin估計(jì),關(guān)于該項(xiàng)目迄今為止所作的財(cái)政承諾總計(jì)約2億美元。這是該項(xiàng)目為期3年的“第一階段”的預(yù)估成本的1/3。這一階段打算對9000類已知的真核生物中的每一類的至少1個(gè)物種的基因組進(jìn)行測序。他希望在1年內(nèi)籌集到剩余的資金。

地球生物基因組計(jì)劃包括十多個(gè)現(xiàn)有的測序項(xiàng)目。例如生命之樹的特定分支,如鳥類、昆蟲和植物;或者對于一個(gè)特定國家的生物多樣性的研究,如在英國被正式稱為達(dá)爾文生命之樹的項(xiàng)目。

Lewin表示:“我們不需要一個(gè)基因組計(jì)劃來控制所有的項(xiàng)目。”相反,他說,這項(xiàng)努力存在的理由便是為了確保正在進(jìn)行的生物多樣性測序工作的標(biāo)準(zhǔn)化。

“當(dāng)你接近不同的科學(xué)團(tuán)體后,會發(fā)現(xiàn)那是處于混亂和無政府狀態(tài)的。”Lewin說,“如果到最后,每個(gè)人都在做自己的事情,那得到的就是巴別塔了。”

在此次倫敦召開的會議上,與會者討論了樣本采集、測序、數(shù)據(jù)管理和共享的指導(dǎo)方針。Lewin認(rèn)為,制定這樣的標(biāo)準(zhǔn)對于使基因組對所有的科學(xué)家都有用——而不僅僅是對某一特定領(lǐng)域的科學(xué)家有用,是至關(guān)重要的。

參與這項(xiàng)工作的科學(xué)家說,因?yàn)榈厍蛏锘蚪M計(jì)劃是一個(gè)傘形組織,它對于確保測序工作能夠覆蓋所有生命科學(xué)分支也很有價(jià)值,而不僅僅是那些之前吸引科學(xué)家關(guān)注的領(lǐng)域。

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